作者Asialin ( )
看板Biotech
标题[求救] blast的结果老是No significant similarity found...
时间Fri Jan 15 13:04:08 2010
我是用PCR的方法来侦测是否有Tricomonas的感染
每次检测都有一些sample无法判断究竟是否阳性
它们都是single band，亮度正常，但较预期大小稍大一些
我把其中几个的PCR产物纯化之後送定序後做alignment
确定这些来自不同sample的PCR产物序列都相同
再将此序列用NCBI做blast (大小为482bp，不算太大)
结果却是No significant similarity found....
不同批实验、不同个sample，做出来都是相同序列
所以我觉得序列本身应该没有问题
但为什麽无法找到相符的资料？
希望板上有blast达人可以解决我的问题
或者告诉我除了NCBI之外，还有没有别的资料库可以用
感谢 > <
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.40.27
1F：推 bigcat24:BLASTN 若用错资料库 就会找不到哩 01/15 18:04
2F：→ wt1seven:database选others 若不选是内建比human的 01/15 22:13
3F：→ Asialin:我原本就是选others，用的db是nt/nr 01/15 22:16
4F：→ ssbin:d/b换成HTGS试试看呢? 01/22 18:07