作者aggaci (超好看的笃姬!)
看板Biotech
标题Re: [求救] western的internal control 调不匀
时间Tue Nov 10 11:47:59 2009
※ 引述《katty7389 (被风吹跑了~)》之铭言:
: 大家好我是做western blotting的新手
: 最近实验遇到瓶颈.想请大家帮忙
: 最近我在做KB跟L30 protein的表现
: 可是发现每次压出来的internal control都不均匀
: (我有分fraction, cytoplasm是压b-tubulin. nucleus是压lamin B)
: 我猜想几个可能造成的原因
: 1.收细胞时,medium去除不乾净 影响定量的结果
: 2.收细胞时 两个细胞收的量不太一样 影响定量结果
: 3.因为我把sample跟sample buffer加在一起之後去加热.在loading到SDS-PAGE
: 时发现体积会比原本两者混在一起的体积还少.我觉得自己使用pipette的技术
: 没有问题.我在想会不会是这个环节有问题
loading前用小乌龟稍微离心一下即可,internal control不均匀应该不是这个问题
: 因为只是猜测 不确定是哪边出了问题
: 不过因为问题没有解决 我有点害怕进行下一个实验 所以想请大家帮我看看
: 这边附上我收细胞到loading sample的流程 请大家帮我指正
: 1。用trypsin打下细胞。离心12000rpm 去除medium再用PBS wash一次
: 2。离心 去除PBS
: 3.用0.4M LYSIS buffer I与cell pellet mix
: 4。on ice 15 min
: 5.加入10%np40 votex後离心13000rpm 取上清液即为cytoplasmic extract
: 6.加入lysis buffer II与cell pellet mix
: 7。15分钟内 约每1分钟vortex 10秒
: 8。离心13000rpm 取上清液即为nucleus extract
: 9.将取得的sample做定量
: 10。定量的结果假设为2.41μg/μl,我每个well想loading 40μg.就加
: 16。5μl的sample与4μl 6x的sample buffer混匀(无论多少sample
:
: 都加4μl的sample buffer)
这里有补水至相同体积吧?
: 11.100度煮protein 10分钟
: 12。loading sample
定量时的标准曲线的R square是否大於0.995?是否有blank?
: 有错麻烦大家指正 谢谢
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.253.186
※ 编辑: aggaci 来自: 140.116.253.186 (11/10 11:48)
1F:→ DFS:对了 借问一下补水到底有什麽影响吗?有的实验室都不补水耶 11/10 12:48
2F:→ DFS:不是只要每well的sample量一样即可? 体积会影响跑胶的结果吗? 11/10 12:49
3F:推 tsubasawolfy:补水是为了sample buffer的倍数吧? 11/10 13:40
4F:推 katty7389:不,我没有补水 实验是有些学长直接用6xdye补体积 11/10 14:26
5F:→ katty7389:我也想知道体积会不会影响跑胶结果 我的band都歪歪的 11/10 14:28
6F:→ katty7389:我有设Blank r值也有大於0.995 11/10 14:29
7F:→ ordinary07:你有测你lysis buffer会不会影响定量结果吗 11/10 16:22
8F:→ ordinary07:体积会影响跑得结果阿 看就知道拉 体积小的会被压 11/10 16:23
9F:→ ordinary07:还有应该是加 1Xdye(用lysis buffer稀释)比较合理 XD 11/10 16:24
10F:→ ordinary07:当然如果加其他东西跑得出漂亮的结果就好 11/10 16:25
11F:推 bider:你取sample时 tip会插入液面下太多吗? 11/11 00:02
12F:→ katty7389:取溶液的中间 不过取完我都会尽量把TIP多余的液体回掉 11/11 00:26
13F:→ katty7389:tip周边沾到的液体 11/11 00:27