作者vancent (新的乡民XD)
看板Biotech
标题[问题]关於PRIMER设计和BLAST的问题
时间Wed Aug 26 18:11:34 2009
不好意思想请问各位我步骤上哪边有问题
因为今天设计的PRIMER去BLAST都是很多HIT啊XD
首先
找特定GENE~选其CDS序列丢入pick primer
选好product size後~tm值分别是 min 53 opt 56 max 59
DATABASE选第一个~然後pick
pick出来的再丢到blast比对
一次丢一条forward或reverse(也就是分开丢)
database选human g+t
program选megablast
然後就让他跑~
但每次出来都是好几百条hit啊@@"
是我哪边勾选错误吗?
blast时f和r一起放我也试过了
但不太清楚是哪边的问题
麻烦各位了!谢谢!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.121.97
1F：→ vancent:忘了说~GC比是40~60% 08/26 18:14
2F：→ cloudcc:NCBI的BLAST TOOL吗? 那BLAST有PRIMER BLAST可以选喔 08/26 19:41