作者nzj (edger)
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标题Re: [求救] 怎麽改善蛋白诱导的solubility?
时间Thu Jul 30 03:25:12 2009
我不太清楚你的实验目的为何,不过从结果来看,可以推论这蛋白质的稳定,
离子键扮演重要的角色,因此当D变成E的时候,因都带负电所以没什麽影响,
可是当带正电Arg变成不带电的Ala,因此无法形成离子键,因此会影响蛋白
质的稳定,因而影响摺叠。
在实验的部份,用低温的策略是可行的,不过转速可以调慢,慢慢震荡就好了,
另外表现时菌液的浓度O.D.600=0.8有点高,也许可以试试0.4-0.6。而IPTG
的浓度uM等级就可以了。如果再不行的话可以加3-5% 的ethanol促进
chaperone的表现,也许可以帮助摺叠。表现的部份就试条件,也许运气好就
让你试到了。
当然也可拿inclusion bodies来做refolding,这个方法也不见得会成功
。可以将inclsion bodies溶在urea或者guanidium chloride然後将
solution慢慢倒入refolding buffer,使urea的浓度降到1.8-2.3 M。
另外也可将溶在urea的proteins以梯度透析的方式降低urea的浓度,
避免浓度变化过快,而影响proteins folding。另外也有一种方法就
是改变pH值将cofactor加入。方法有很多,不过还是要看蛋白质的特性。
如果还是不行,就试试不同的表现系统,如真菌的yeast。glycosylation
会稳定蛋白质的结构,也许可以帮助蛋白质摺叠。
另外很多膜蛋白不溶於极性的溶液中,因此加入detergent,来帮助solubility。
这个方法可用来养晶。
※ 引述《BLACKOA (OA)》之铭言:
: 大家好,小弟在蛋白诱导上遇到了一个问题
: 我想要诱导的蛋白原本是在D70E有做改变
: 然後我在BL21/pLysS,在pET15b(low copy number)上做诱导
: 简单的诱导过程如下:
: 1. O/N culture in LB with antibiotics and 0.1% glucose
: 2. 1:100 diluted in 200ml LB (500ml flask) with 0.01% glucose
: shaking culture at 37度C, 200 rpm until OD600 reaches 0.8
: 3. add IPTG to final concentration 1mM and shaking culture at 18度C, 200rpm
: 4. 1 hour later, collect bacteria and disrupt them
: 5. pellet and the supernatant of the disrupted bacteria were collected
: 6. western blot
: 基本上是这样,然後可以看到只有D70E突变的蛋白可以明显诱导出来,而且是
: soluble form居多(因为可以在disrupted bacteira的supernantant看到诱导的蛋白)
: 可是
: 假如同时做R242A的突变时(也就是现在的蛋白同时有D70E跟R242A的突变)
: 在同样的系统与条件下诱导的时候
: 却发现蛋白主要都是在inclusion body里面,几乎都是insoluble form
: 觉得很奇怪
: 不晓得有没有人对於这个有任何想法吗?
: 我自己正在试降低IPTG的浓度(想要试0.5mM, 0.1mM, 0.05mM),
: 然後想要把induction的温度降到16度C
: 想要试着降低诱导的速度
: 看能不能改善蛋白的溶解度
: 不过,
: 想在这边跟大家请教看看有没有别的想法
: 谢谢
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