: X-光小角度散射(SAXS)在生物物理方面 : 基本上是用x-ray来看protein的radius of gyration : 第一张跟第三张一起讲 因为是同一种图 : Y轴是intensity(counts)代表散射光强度 : X轴 q= sin(theta)/lambda 为momentum transfer : 基本上就是一个跟散射角有关的物理量 因为周期性结构的qr=2π时干涉最明显 q:入射角与折射角的向量差(nm^-1) r:两原子之束缚电子间的距离(nm) 2π r=── q 所以仪器测得的q越小算出来的距离尺度越大 大 小 : 这种图的profile会给你结构上的资讯 : X轴上愈小的给在结构上愈大的资讯 例如protein的shape : 再右边一点就小一点 看fold...更右边看atomic information : 第二张图 p(r)是electron pair distribution function : 基本上是由图一跟图三这种scattering curve做复立叶转换来的 : 这我不知道怎麽措词比较好 : 看看下面这个例子应该比较简单明了 : http://scattering.tripod.com/calpr.html : 当这个protein在做comformational change的时候 : 可以注意到此分布的变化 : 当两个domain分开的时候 可以看到两个peak : 靠近的时候 会merge成一个peak pair distance distribution function p(r) 包含两个变数的积分: 1.r:定义同上 2.γ(r):各种r的出现机率 所以连结动画中分子打开成2个subunit时p(r)在长距离和短距离r机率都很高 闭合 球状 只在原子间距中距离的出现机率最高。 : 要知道SAXS基本原理的话书上找的到 : 我不是这方面的专家 : 更detail的再请板上的高手补充 :) --

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