作者missal (那些日子)
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标题Re: [求救] X-光小角度散射图解释
时间Tue Jul 28 22:44:00 2009
※ 引述《goldfish0909 (金鱼)》之铭言:
: 【问题】:
: X-光小角度散射图解释
: 【问题起因】:
: 文献上的X-光小角度散射图看不懂,无法解释结果,样品是蛋白质
: 【个人看法】:
: 看了英文解释,只知道图中的实体曲线是利用软体预测出来的,空心圆圈是实际
: 实验的图,两者趋势相似,但三个图中的横坐标及纵座标单位分别代表的意思是
: 什麽? 以及图形的趋势要如呵解释? 请有这方面专长的大大帮个忙,谢谢~~~~
: 以下是三个图的连结:
: http://0rz.tw/M9xaD
: http://0rz.tw/4MumC
: http://0rz.tw/zeMw7
X-光小角度散射(SAXS)在生物物理方面
基本上是用x-ray来看protein的radius of gyration
第一张跟第三张一起讲 因为是同一种图
Y轴是intensity(counts)代表散射光强度
X轴 q= sin(theta)/lambda 为momentum transfer
基本上就是一个跟散射角有关的物理量
这种图的profile会给你结构上的资讯
X轴上愈小的给在结构上愈大的资讯 例如protein的shape
再右边一点就小一点 看fold...更右边看atomic information
第二张图 p(r)是electron pair distribution function
基本上是由图一跟图三这种scattering curve做复立叶转换来的
这我不知道怎麽措词比较好
看看下面这个例子应该比较简单明了
http://scattering.tripod.com/calpr.html
当这个protein在做comformational change的时候
可以注意到此分布的变化
当两个domain分开的时候 可以看到两个peak
靠近的时候 会merge成一个peak
要知道SAXS基本原理的话书上找的到
我不是这方面的专家
更detail的再请板上的高手补充 :)
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 128.220.160.6
1F:推 chvkimo:完全听不懂 因为我根本不是学这方面的. M大好威阿 07/28 23:47
2F:推 goldfish0909:太感谢了~~~~~ 07/29 11:49