作者yashi (我要天天快乐快乐)
看板Biotech
标题Re: [求救] DNA电泳
时间Wed Jul 22 15:44:29 2009
※ 引述《chl20020933 (chl20020933)》之铭言:
: ※ 引述《yashi (我要天天快乐快乐)》之铭言:
: 昨天看到已经很晚了 所以到现在才回
: : 先谢谢很多人愿意帮我一起厘清问题
: : 其实我个人比较倾向是buffer或是sample的问题哎
: 同s大表示 如果是这些问题 你的marker不会那麽清楚
: : 因为我这个实验重覆满多次了
: : 条件都是一样的 1%的胶100V跑40min
: : 不过之前都没有这方面的问题
: : 而且这次的sample是real-time完的产物
: : 而我同时也有跑melting curve
: : melting是一个很漂亮的peak
: 这我没有做很多
: 不确定real-time侦测到的萤光 比实际的"specific" PCR product是不是绝对正确
: 也不知道是不是这原因 你们老师才要求你要跑GE
我们老师只觉得用melting curve看不出来 分子量
而且他喜欢"眼见为凭"的感觉
: 但是gel图看起来 不知道是背景 还是non-specific 的smear
嗯嗯 这点我也不确定是产物本身就不专一 还是胶让它smear
不过我还满相信melting curve的
: : 我p完的产物放在-20℃冰箱三天我就跑了
: : PCR的program也不太可能有人动到…
: : 因为我们实验室就只有我疯狂的在跑real-time PCR
: : agrose我也都用一样的
: : 附带一题
: : 我的这个照片是用 切胶片用的光箱+数位相机+滤镜照出来的
: : 所以可能照片跟照胶器照出来的 品质会差很多0rz...
: : 还有我不太了解 所谓的well里面卡住的是template DNA是什麽意思…??
: : 是代表我的template DNA加太多 所以反应不完全吗?
: 我会说template DNA卡在那边 因为看你的marker应该是100bp-3k的吧
: 所以上面残留的大小 应该是template DNA才对
: 然後看染色的结果 相对来说 背景那麽强 只有60bp的 band一定会看不到
: 另外 你的gel只有1% 以往我们要分50-500bp的band都用到3%的gel
可是我以前用相同条件跑
我觉得结果还ok哎!!
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=yashihuang&b=17&f=1299448890&p=4
: 或是 5%的 poly-acrylamide gel
: 1%跑 60bp 跑到下面都糊掉了(你可以看marker的100bp)
: 片段又很小很难染色 所以什麽都看不到
: : 如果是这样的话可以从real-time PCR的curve或是melting curve看出来吗?
: : (我觉得如果template DNA很多的话 melting curve应该会很丑吧???)
: : 最後 谢谢大家努力帮我解决!!
谢谢^^
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.23.86
1F:→ seal0413:Check your reagent!!! 07/22 16:52
2F:推 duest:看完两次图後 我觉得是你跑胶跑太久ㄟ 07/22 17:48
3F:→ duest:你的染剂代的电荷跑胶时刚好会往上跑 07/22 17:49
4F:→ duest:当你DNA在胶上那区域刚好染剂都跑光了 颜色当然也变浅 07/22 17:50
5F:→ yashi:那我会减短时间看看! 谢谢 07/22 23:54