作者soom ()
看板Biotech
标题Re: [讨论] 侦测miRNA
时间Sat Jul 11 13:19:28 2009
※ 引述《xxman5359 (ALAN)》之铭言:
: 想请问大家利用real-time PCR侦测miRNA的表现量时所使用的control是哪一种?
还是希望这位板友参考发文规范多打一点字,毕竟一行文很难清楚的问一个问题
这个问题其实应该要问的更仔细一点并且请把你所遇到的难题试着描述出来
比如你今天是要做哪种样本? 已经做了什麽实验得到什麽结果? 所以发现有什麽问题?
另外你所说的control是指什麽?一个实验最重要也至少应该要有的三种control
包含了positive, negative, internal
negative control就是一定要做不出来的control
可以是把template拿来用灭菌水替代,用在确定PCR反应本身有没有污染
可以是在转cDNA时不加反转录脢的RNA control,用在确定RT反应有没有污染
positive control则是一定要做出来的control,用在确定RT或PCR过程有没有出错
可以是确定有表现目标miRNA的样本,可以是你的样本里面一定会表现的基因
甚至狠一点直接把你目标miRNA序列拿去合成primer都可以当做positive control
internal control则是在你的每个样本里面表现量应该要一致的control,可以用在
半定量实验结果或甚至是RT或PCR反应的确效
internal control则多半是看你的样本决定,在miRNA的实验里面常用到的是rRNA
像是U6, 18s 这些都常常看到,primer序列也可以在网路上找到
需要注意的是这些control彼此是独立的,而且一个实验的流程通常必须要有多组的
positive及negative control。上面列出来的control是我会在某一组实验里面全部
都做的,所以常常会发现我只想要比较两个sample中某个miRNA的表现量,但所需要
的control组都比实验组多的多,还每个都要三重复
希望以上的唠叨对你有帮助,也还希望你做出什麽结果有什麽心得都要上来分享一下
那怕是几行字,因为也许我们都可以从中学到些什麽。但若是你最後选择沉默,那也就
失去了在讨论版上发问的意义了
祝 实验顺利
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 114.44.14.80
1F:推 tchan:推!清楚明了的实验设计逻辑,看似简单却很多人会忽略... 07/11 15:04
2F:推 higamanami:"目标miRNA序列拿去合成primer" 这句是.... 07/11 16:09
3F:→ soom:那是不建议使用的偷吃步.. 07/11 22:35