作者xpr999 (xpr)
看板Biotech
标题Re: [求救] 关於重组target protein
时间Wed Jul 8 23:43:32 2009
※ 引述《reiosea (reiosea)》之铭言:
: 不好意思我表达不好
: 我想做的是把这个蛋白质重组出来,然後用Phage display找出有键结能力的peptide
: 我想找出可以有潜力去抑制这个化学感受器功能的peptides。
: 所以我只需要他露在细胞膜外的结构,而不要求其功能。
: 但是我现在卡在似乎这蛋白为unsoluble protein.
: 我怕说在做重组时这个蛋白会很难分离纯化。
: 那我想说是不是可以只把它soluble的部份做重组就好(当然这个部位必须是在细菌膜
: 外)。
: 我想问的是这样的方法可行吗?
: 再来是我该如何去找出这个蛋白质哪一段是可溶哪段是不可溶。
: 我去跑TMHMM发现这个蛋白质都是在膜外。
: 这意味着她其实为可溶性?
: 可以以此为依据吗?
对不起小弟能力有限 只好帮分析一下原PO的问题 没办法建议 囧
已有
一段cDNA encoding 一段"疑似"是membrane protein
目标
想找出这一段蛋白质的soluble 的 binding domain 的 target
问题
1.确定soluble binding domain 是extracellular 还是intracellcular?
2.TMHMM只是预测 有确定的aa sequence(cDNA)吗? 其他网站有可靠的structure吗?
3.原PO似乎想切割soulble domain 来进行重组(+tag)以便以分子的方式来筛选标的物?
4.细胞原生可行吗?overexpress这个protein 在细胞上 然後在用标的物去筛选? 不过比较麻烦
待补充.........
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