作者NKTcell (NKTcell)
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标题Re: [求救] 请教Western blot的问题
时间Sat Jun 13 01:56:04 2009
※ 引述《soceress (赢了世界又如何)》之铭言:
: 1.page的配方与running buffer,transfer buffer的关系
: 以前的实验室的gel用的是molecular cloning里的配方
: (30% acrylamide,1.5M pH8.8 Tris-HCl,SDS,APS,TEMED..这是下胶)
: running buffer:含SDS的Tris-Glycine
: transfer buffer:含SDS,Tris,Glycine,MeOH 20%
: 现在这个实验室用的是
: 30% acrylamide,3.0M pH8.8 Tris-HCl,40% glycerol,APS, TEMED
: running buffer:含SDS的Tris-Tricine
: transfer buffer:不含SDS,其余同上
: 胶的配方主要差在SDS和glycerol
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主要不是差在那两种喔~
glycerol只是要增加SDS gel的density
主要是差在running buffer的
Tris-Glycine及
Tris-Tricine
这个差很多!!!
另外 你确定running buffer含有Tris-Glycine的下层胶Tris-HCl PH是8.8吗?
印象中好像是8.45 你可能要再查查看0.0?
: 请问这两种胶的用途有什麽不同呢??
Tricine的 适合用来跑小分子蛋白 resolution佳
视胶浓度的不同 小到2kDa也可以明显区分出来
一般的SDS PAGE比较没办法跑那麽仔细
原理的话就要自己去查查看噜
: 如果上面的胶配上下面的transfer buffer会不会transfer效率变差??
: 如果上面的胶配上下面的running buffer会不会有问题?? (比方说胶过烫)
: 我要跑的是60~70KD的蛋白质
一般Tricine-SDS-PAGE 有分Anode及Cathode buffer PH分别是8.9及8.25
混着跑... 我也不知道会不会有问题
剩下的问题有劳其他人补充啦~
: 2.transfer的条件如果改变会影响data趋势吗??
: 用含SDS与不含SDS的transfer buffer,趋势会不同吗??
: 目前学姐们有三种条件(大家用的都不一样^^||),要看的仍是60~70KD的蛋白质
: a. 120V transfer 1.5hr
: b. 100V transfer 1.5hr
: c. 50V transfer 4hr
: 自己是觉得应该不会改变趋势...
: 我一直习惯用b,做出来和一年前刚到新实验室用a的结果相反......n=4,三重覆
: 於是试着用c,趋势和b一样
: 3.同一个sample同时load跑四片
: 染了同一个抗体,理论上4片的target protein都可以染得很清楚(这是已经确定的)
: 结果固定某个检体,两片有(明显),两片没有(定量结果为0)
: 听别人说可能是power supply在transfer过程中短路
: 还有没有别的可能呢??
: 感谢各位耐心看完~~~
: 先谢谢大家的帮忙~~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.138.178
1F:推 soceress:是指两个铸胶配方的差别是一个有SDS,另一个没有.. 06/13 13:32
2F:→ soceress:一个有glycerol,另一个没有~ pH是8.8..BioRad的161-0798 06/13 13:33
3F:推 soceress:谢谢你回覆喔~~~~~ 06/13 13:35
4F:推 leoblack:没SDS,是native gel的配方嘛?! 06/13 15:18
5F:推 soceress:不是喔~ 06/13 22:33
6F:推 leoblack:那强行让蛋白质带负电且拉成一直线的介面活性剂是谁!? 06/13 23:27
7F:推 soceress:running buffer里有SDS~ 06/14 00:34
8F:→ soceress:使用的sample buffer也是有SDS的 06/14 00:35
9F:→ soceress:我好像会错意XD 学姐说可加可不加,所以觉得不是native 06/14 00:50