作者pocession (阿宗)
看板Biotech
标题[求救] Triton X 114 partitioning
时间Mon Jun 8 10:34:47 2009
我是以Triton X 114 partitioning来进行membrane protein extraction的实验
但在执行上出了一些问题
想请问大家一下
这方法的原理大致上是这样的,
首先将细菌悬浮在含有1% triton x 114的buffer中,
并且置於冰上使蛋白质溶解於buffer,
接着离心去除细胞残渣,
然後转移至高温(>30度),
Triton series detergent在较高的温度时,
水溶性会降低,
detergent会自行聚合,
接着再以离心的方式,
将溶液分成aqeuos phase和detergnet phase,
deterent phase因密度较重,会出现於管中的下层,
而此时membrane protein就会溶於下层detergent phase。
但是在操作上出了一些问题:
首先我的实验对象是Mycoplasma fermentans,
但是我以buffer悬浮它时,并以离心去除不溶的沉淀物时,
发现含有1% triton x 114 buffer并无法对菌体产生破菌
而有大量的沉淀物出现
而这个问题似乎影响了之後蛋白质萃取的量
请问这样的现象正常吗?
如果我怀疑菌没破,
是否应该在实验开始前引入破菌的步骤(free and thaw,sonication等)
第二个是我照着protocol上讲解的操作,
发现分层并不明显,因此我改用较高比例的triton X 114进行实验
分层现象虽然明显
但却造成detergent phase中triton x 114的比例太高,
於SDS PAGE分析时影响蛋白质在胶中的移动,
可是几乎所有的protocol都是写1% tx114,
请问1% TX114会太少吗?为什麽我没办法分层呢?
第三个问题则是有些PROTOCOL上写要以swinging bucket rotor来进行离心
不过由於我没有这种设备,因此我仅使用一般桌上型的离心机来进行离心
请问这样的离心会对分层产生影响吗?
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