作者fc01 ()
看板Biotech
标题Re: [问题] PCR及一些生物技术的问题
时间Tue Mar 31 20:42:51 2009
※ 引述《drave ((  ̄ c ̄)y▂ξ)》之铭言:
: 有学过普通的生物化学
: 但都是粗浅地点到为止...
: 想问一下
: 1.
: 万一对未知序列跑PCR的时候
: 那要如何知道要用何种primer?
: 这样头端的硷基是未知 不就跑不起来了?
: 2.
: 接着是RFLP
: 最後的步骤不是要用探针去hybrid
: 探针不是设计出来的吗...怎麽知道要设计怎样的探针
: 才能与那些片段hybrid
: 还是说做RFLP的时候待测DNA也要是已知???
这讲的是古典的RFLP,实际上现在几乎所有人都做PCR-RFLP
原理是先把已知的片段用PCR扩增出来在用限制酵素切割观察是否有点突变
所以当然必须知道目标序列为何
: 3.
: 为什麽AFLP比RFLP更能判读出差异???
: AFLP不是就等於RFLP+PCR?
AFLP是"先用限制酵素切gDNA,再用接合酵素把设计好的核酸接合子黏到切点上
最後再用和接合子互补的引子跑PCR"
PCR-RFLP是"先做PCR,再用限制酵素切PCR产物"
: RFLP缺点在於限制酵素切的片段太过多 导致条带可能会连起来
: 这样AFLP跑出来不会有这种情形吗
如上所述,AFLP酵素切的范围是"整个基因体",所以条带远多於PCR-RFLP
一般来说,RFLP是针对已知的序列来侦测点突变
AFLP是对序列资讯未知的情况进行研究,两者对象完全不同
(AFLP光看上面要对整个基因体又切又黏就知道酵素用量会用到破表,
如果发现条带数太复杂不能用一般胶体分析,还得把引子标萤光跑毛细管电泳...
一言以蔽之,这是一个很贵的技术,所以一般能用RAPD还是用RAPD)
: 还是我哪里搞错了?
: 这样PCR-RFLP和AFLP有啥不同= ="?
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1F:推 drave:thanks! 04/02 02:23