作者rmp4vu03 (小叶)
看板Biotech
标题Re: [求救] 从NCBI取得蛋白质序列
时间Thu Mar 26 21:50:42 2009
※ 引述《inhan (积极进取的小进)》之铭言:
: 大家好,我是资工所的学生
: 毕业论文题目为蛋白质序列分析
: 需要约数千笔蛋白质序列
: 最近程式已写完,需要真实资料来跑结果
: 因为初次使用NCBI网站
: 不太清楚如何只截取出蛋白质序列的部份 (我猜应该有这功能??)
: 或是有更好的蛋白质资料库网站,可以只截取蛋白质序列的部份
: 希望好心人士教我,谢谢大家
现在NCBI跟日欧资料库早已资料整合了
你进入NCBI後,在search选 Structure
打蛋白名或自己选代码,NCBI的PDB是用四码 MMBD是用5码
1.内建是cn3D
2.可自行下载PDB Viewer,利用这套软体看PDB档,选点PDB ID 里面有 载点
这套软体功能应该就够你用了
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?uid=33897
举个例子:1ZMC 是 Human dihydrolipoamide dehydrogenase
里面自然有分成8个Domain让你分析
自行玩玩看,若你是资工系的还可以玩里面有程式档可供下载
里面的语法相信你应该不陌生
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你能告诉我...这远方到底有什麽...
○
¯ ̄ ﹉﹊ 我 祈 许 着 . . .
((∕\ ¯ ̄﹉
﹎﹊
■Π
﹌ 能 够 找 到 解 答...
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 61.62.28.245
※ 编辑: rmp4vu03 来自: 61.62.28.245 (03/26 21:51)
1F:推 inhan:感谢回答 :) 03/27 00:01