作者artery (酸糖果)
看板Biotech
标题[求救] Q-PCR
时间Sun Dec 21 01:01:07 2008
最近在做Q-PCR碰到一些问题,请大家帮忙,谢谢
问题一:
我把磨好的RNA转成cDNA後
先用一般PCR拿actin当primer
来先确认我的RNA有没有问题
结果:只有single band
又我的sample是有转基因跟没有转基因的植物
所以我又拿我转基因的primer去pcr
确定没有转基因没有band,而有转基因的植物有band
并且都是single band
所以接下来我就直接拿这些sample当template
来进行Q-PCR
看结果是有萤光被侦测到(有被放大)
但是NTC和sample被放大的倍数是一样的
然後melting curve非常专一(包括NTC都有起来)
然後跑胶之後
NTC是空的
但sample的部份全都smear
请问 这是怎麽一回事?
是不是我的sample有DNA污染?
还是......?
问题二:
我设计一组A gene的primer,预期要p到的大小为200bp
所以我先用一般的pcr进行测试
但不论怎麽p,提高温度还是什麽的
p到的长度都是450bp左右,并且是single band
但一样的产物,换另一组B gene当primer进行PCR
得到的结果和预期的大小是一样的
再换另一组不同的C gene,也和预期大小一样
请问,A gene那组的primer发生什麽问题?
还是那里出了问题?
麻烦线上的高手们帮忙解答
这实验卡了也一阵子了
我想快毕业走人
就剩这个实验了
请大家帮忙,谢谢
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3F:→ artery:有做negative control都没问题 12/24 11:56