作者miniprep (小准备!)
看板Biotech
标题[求救] RE Digestion
时间Sun Oct 5 22:35:18 2008
由於上周做了一次ligation之後盘子也长了几个colony
就快快乐乐的养了菌,抽了DNA(geneaid的kit),就直接用我接进去的site
(AgeI-insert-BamHI),之前这个组合拿来切Vector跟Insert都很顺利
可是拿来切construct的时候,就发生了意想不到的状况。
切完的结果非常诡异,很像是gel不小心用水配的结果(可是ladder是完整的,胶没错)
每一个well下面都没有band,而是很亮的类似comet tail的东西。(跟sono很像= =)
怀疑是colony或RE的问题就分开来切,但是结果single digestion结果都合理。
也都出现single band,长度也接近(约8.3kb)。
这样的状况还有那些可能呢?
目前已知:
1. RE没问题
2. DNA,或许,没问题。
那剩下的可能是?
3. methylation interference?
4. 我手残?(虽然不想承认,但是先怀疑自己比较好,可是我repeat两次了)
5. 换一组RE来切?
6. 直接拿去transient transfect看reporter gene算了?
拜托帮我解个惑吧...Orz
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 220.135.72.79
1F:推 senlin:送定序最准 10/06 04:31
2F:推 blence:假设没有其他常见的出错下,看你选的RE会觉得明显是问题所在 10/06 04:52
3F:→ blence:为了double digest屈就buffer,又用了常有star activity的RE 10/06 04:54