作者momo1210 (请叫我呼呼狗 旺旺)
看板Biotech
标题[求救] snp所在或邻近的基因
时间Fri Sep 19 17:06:57 2008
我想要求救生物资讯比较厉害的版友一个问题>///<
假设今天我知道一个SNP 例如rs728370 也知道他在第几条染色体
现在我想要查出它的physical location
还有它在的基因或者最接近的基因是哪一个
以及它相对於该基因的位置(例如位於promoter 还是位於下游coding区等)
请问我需要用什麽搜寻引擎或者网站资料库比较能快速找到我想要的东西呢?
(详细做法指示?)
希望有好心的人可以为我解答
我手上有50个snp需要查>//<
但对生物资讯这方面的东西都不太了解
很谢谢你们的帮忙! (_ _)
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 163.25.118.75
1F：→ sGoat:请问物种?如果不是完全解序的有难度... 09/19 17:18
2F：推 tezufuji:试看看NCBI里的SNP database? 09/19 18:47
3F：→ momo1210:是人类的,今天有尝试用ncbi,可以查到该序列所在的位置 09/19 21:33
4F：→ momo1210:我在想是不是可以在由位置反查回去基因? @@ 09/19 21:33
5F：→ momo1210:因为位置都是physical location 只由一个数字表示 09/19 21:34
7F：推 tezufuji:NCBI里有项是GeneView应该就是指位於哪个基因上 09/20 12:06
8F：→ tezufuji:没有的话应该就是这个SNP没有在已知的基因上...吧? 09/20 12:07
10F：→ momo1210:真的很谢谢!!! 很棒的资讯~ ^^ 09/21 11:01
12F：→ Ice9:虽然要注册才能用。不过，它是免费的，不玩可惜。 09/22 20:52