作者lail (逃避不是办法阿)
看板Biotech
标题[求救] promoter上TFBS预测後的解读
时间Mon Sep 1 00:56:11 2008
最近在cloning几个基因的promoter
也要对其上可能具有的transcription factor binding site做预测
我使用的线上软体有TESS,TFSEARCH,以及PROMO (这是爬文找到的)
但是我将序列输进去之後,得到的结果我却不会分析了.
使用TESS分析之後,找到的可能结合位有一大堆,但是他给的许多数据我却看不懂
(有去网页上看过,但是对於其定义还是不了解)
使用TFSEARCH,可以自己设定"score"
虽然网页上有给score的算法,但是我不懂他的意思
score = 100.0 * ('weighted sum' - min) / (max - min)
什麽叫做weighted sum,又min,max代表什麽
以及大家设定score时,会设最低的score值为何呢?
另外promo...也是会得到非常多的可能TF binding site
请问有人可以敎我到底要怎麽分析所得到的结果
真的是万分感谢了~
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◆ From: 122.121.180.136
2F：推 realrex:请问MatInspector是线上搜寻,还是要安装软体呢? 10/15 16:23