作者voen (新的开始~加油吧)
看板Biotech
标题Re: [求救] 分段cloning
时间Fri Aug 29 01:31:02 2008
※ 引述《veltine (Time go by~~~)》之铭言:
: ※ 引述《sGoat (无三小羚羊)》之铭言:
: : 先无差别clone起来再去做Rapid Screen,挑出你要的3.5K的clone来做...
: 我是用Advantage 2 Polymerase号称可以PCR出13kb!
: 用Pfu P完直接ligation是接不起来的欧...
: 因为PCR product没有多一个A…对了为啥会多一个A啊?
: : 1.将你步骤一PCR出来的3.5K片段clone进T-A cloning vector...
: : 挑出来之後纯化 > 用你设计的酵素double digestion > 酒精沉淀,回溶
: : 2.将你的vector以你要的酵素做double digestion > 酒精沉淀,回溶
: : 3.算好molar ratio後将1.2.加在一起ligation
: : 便宜简单又不用check正反接
: 是的,其它的gene我也是用这种方法接上去的…
: 非常的简单,但是TA vector有点贵…Orz
: 为什麽想分段cloning,主要原因是我的PCR有很多band,虽然直接
: 把3.5kb的gel切下来做cloning,但是定序完之後并不是我想要的
: gene…Orz
: : 因为你Tm要是设太高primer跟template已经是若即若离了
: : 太严苛的条件是P不出来的...
: : 太长时间扩增,长时间高温也是不好...
: 其实我都P的出来,主要是gel上非专一性的band很多…
: 太长时间扩增…一般我都跑到30个cycl…
: 感谢大家的回答
我之前也是要将一段gene clone (636bp)出来
再和一段140bp的promoter 及 310bp的terminator接起来
那时用的方式是overlap PCR 但最後会有其他杂band
改变许多方式 但定序後都不是完整的整段序列
所以最後改为 直接将两片段ligation 连接成整段1kb大小再塞进TA
以下是图示
776bp
PciI-promoter--gene---KpnI
KpnI--terminator-PciI
310bp
室温下ligation 3h, 1:3比例
最後有成功将776和310片段接起来再挖胶 末端加A 之後送进TA
虽然步骤繁琐转且形效率很低(6颗 colony 0rz) 但命中率高
因为之前试了PCR直接P 是比较快 但是都有杂ban插入TA 必须筛出正确的
改用这个方法 终於成功接入TA 且序列正确
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