作者veltine (Time go by~~~)
看板Biotech
标题[求救] Cloning问题
时间Tue Aug 19 05:15:49 2008
最近在clone一些转录因子大小约1-3kb左右
先简述一下我如何clone…Orz
1.先确定这些基在老鼠身上,何时、何处会表现?
2.利用invitrogen Trizol萃取RNA
3.利用Bio-Rad iScript-cDNA-Synthesis合成cDNA
4.设计primer(长度约30左右,因有加RE site)
QA:不知道是我设计的primer专一性不够高或是其它
原因,PCR完之後跑胶会有很多band?已试过
gradient temp,还是有很多band…Orz,所以我
直接切下我要的大小片段的gel,之後subclone
到Topo vector上,在colony PCR及enzyme digestion
中,其片段大小都是正确的…
QB:我成功ligation几个gene到vector上,定序之後
发现只有primer序列是对的,而中间序列完全是
错的,与老板讨论之後,有可能是genomic DNA
污染了?
QC:回头看看合成cDNA用的kit,说明书上写最佳合成
片段约1kb,但是有我clone出正确的gene约1.5kb
,是这个原因造成我有些gene,clone出来是错误
的序列吗?
QD:有人知道reverse transcriptase的合成速率吗?
一般的incubation时间只要一小时左右,这样要
clone大片段gene会clone的出来吗?可以推荐
clone专用的reverse transcriptase吗?
以上感谢各位回答…谢谢
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