作者albertwang (会思考的鱼)
看板Biotech
标题Re: [求救]请问PCR products用restriction enzymeꐠ…
时间Thu Aug 14 12:36:23 2008
※ 引述《calmato (Anita~)》之铭言:
: ※ 引述《albertwang (会思考的鱼)》之铭言:
: 不好意思~因为我是第一次接触分生~很多东西都是自己try
: 或找资料或问人~所以有很多东西~不知该怎麽问或该注意什麽
: ~所以真的很不好意思~遇到很多问题却自己一直没法解决 >"<
: 厂商给的information 是只有说 To make 100uM stock solution
: add 255 ul of buffer
: 我的working primer是从这里面取10ul primer + 90 ul water
: 那我把我的所有try的条件po上来~但不知道这样是不是您说的反应条件?
: 跑PCR ,total volume 30,water 19.85,primer Forward and reverse
: 各1,10x dNTP 3,10xPCR buffer 3 ,Taq 0.15 ,Template DNA 2
: 以上单位都是ul。但我的DNA浓度品质不一~OD从 40~800 ng/ul
:
10x dNTP 3,Template DNA 2 这两个可以少ㄧ点不过你已经可以做出来
那就不用改了不然出不来又麻烦了
使用restrition enzyme: PCR products 5,water 16.4,10x Buffer 2
: 50X SAM 0.6,enzyme 1;total volume 25,使用的厂牌是Fermentas
: 它的protocal是PCR reaction mixture 10ul(~0.1-0.5ug of DNA)
: water 18 ,10X Buffer Tango 2,50XSAM 0.6,enzyme 1-2
: 因为考量到我的PCR products加10会切不完整,~所以才加5,但照我的想法
: 我的DNA量不算太少,切出来应该会很清楚,但不知为何拍出来照片都很淡
: 我一直找不出原因。
: PCR products 5 这个体积是你纯化过的体积还是pcr 後30ul取出来的体积
不过两个情况都太少ㄧ点
除非你的product 粉浓
如果你怕切不完整那就加长切的时间依你加的enzyme 1
除非是相当特殊的不然16hr应该都还可以work
也想请问您刚说用酒精沉淀,是如何做呢?
: 以上很冗长,感谢您的指教!!
以上有一些问题乡民回答的就不赘述(如buffer)
酒精沉淀 方法你可以到辜狗那找ㄧ下ㄧ定有
至於你这边没有交代
你所run gel 的浓度是几%
不过会出现太淡的话又想要和primer 分开
ㄧ个就是大於5%gel ㄧ个就是用长片(30cm)的gel如果贵实验室没有
那可以用跑protein page去做
然後用低伏特run
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◆ From: 140.114.96.242