作者leondemon (狗狗)
看板Biotech
标题Re: sonication做大片段的碎片
时间Wed Jul 2 13:59:52 2008
※ 引述《leondemon (狗狗)》之铭言:
: 目前我的genomic DNA要做sonication
: 但是跟一般ChIP不一样的是:DNA片段大小不同
: 我目前获得的genomic DNA主要的大片段有两种:3100Kb和282Kb
: 但是我希望它们碎片化的长度为:20~150Kb之间
: 於是似乎sonication就变得非常困难 因为要控制变成那麽长的片段似乎不容易
: 於是来问问看有没有什麽技巧 可以避免过度碎片化 并保持碎片的长度范围稳定?
: 另外要确定长度 是否一定就要使用pulse field Gel electrophoresis?
: sample准备或是进行过程有要注意的吗?
突然想起 利用syringe 好像可以破细胞和gentle降低lysate viscosity(DNA断碎)
这样应该就不用sonication了
但是我没用通过syringe 不知道要用多少G的针头比较适合?
有人有通syringe的经验吗?
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