※ 引述《leondemon (狗狗)》之铭言： : 目前我的genomic DNA要做sonication : 但是跟一般ChIP不一样的是：DNA片段大小不同 : 我目前获得的genomic DNA主要的大片段有两种：3100Kb和282Kb : 但是我希望它们碎片化的长度为：20~150Kb之间 : 於是似乎sonication就变得非常困难 因为要控制变成那麽长的片段似乎不容易 : 於是来问问看有没有什麽技巧 可以避免过度碎片化 并保持碎片的长度范围稳定？ : 另外要确定长度 是否一定就要使用pulse field Gel electrophoresis? : sample准备或是进行过程有要注意的吗？ 依据genomic DNA抽取方法的不同 一开始还没开始打断前的长度可能就不同 一般来说几十K到上百K都有可能吧 所以一开始你应该先确定刚抽取完的长度有多少 如果一开始就太碎　之後就甭谈了 如果不用sonication 我自己知道的办法大概就是做pippeting 你可以分别pippeting比如 100, 200, 300, 400, 500甚至更多次後 一起拿去跑胶来比较shearing後的大小 另外　要比较大小的话 就我所知应该就只有跑PFGE这个方法 --

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