作者countonme (that's just me)
看板Biotech
标题Re: [讨论] cloning
时间Wed Mar 26 18:03:19 2008
: 1.就我个人经验,PCR product做TA cloning时,
: 这样的ligation成功机率非常高,
: 非常容易得到多且正确的colonies。
: 但其他的steaky end ligation很少有如此高的成功率。
: 所以你後来得到的colony数目不多实属正常现象。
: 不过我也不知道为什麽TA ligation的效率会比
: 其他steaky end ligation来得高,
: 有没有高手解答一下?
我认为TA效率高的原因可能是因为 TA ligation
只需T与A一个mer之间的碰撞即可,且TA又是双氢键,键能亦比CG低
反观像是RE digestion的steaky end多为四个mer
所以就机率与键量来说ligation效率应该会比较高
: 2.请问原po有没有注意vector和insert之间的比例?
: 一般来说,
: insert的量必须远高过vector,
: 效率才会好。
: 不过重点是,
: 其实只长一颗也没关系呀,
: 有中就好!!
: 3.检验pEGFP-N1有无被切开,
: 可以跑胶比较切以前和切以後的plasmid大小,
: 虽然被切下的部分只有40-50bp应该看不到,
: 但是如果环形的plasmid有被切成线形,
: 跑胶後大小会和原本的环形差很多。
: 4.不知道你有没有做vector only和insert only的control?
※ 编辑: countonme 来自: 140.114.100.189 (03/26 18:05)