作者epoch (中华队 你是我们的骄傲)
看板Biotech
标题[转录]Re: [问题] 关於real-time PCR的问题
时间Wed Mar 26 09:41:17 2008
※ [本文转录自 Bioindustry 看板]
作者: frela (漫步北台湾) 看板: Bioindustry
标题: Re: [问题] 关於real-time PCR的问题
时间: Tue Mar 25 23:10:33 2008
您好,我是某公司的产品专员,
根据敝公司的SYBR Green supermix KIT标准操作手册中指出,
primer的终浓度一般最好是介於100~500 nM 左右
而您文中之意是贵老师认为最好终浓度在500 nM
而您"不小心"只用了终浓度50 nM
基本上,若不考虑不同产品的优劣性...
您用的量,"会不会太少?"
这个问题...我想很少人可以回答,因为不同的检体或样本
都有可能有其最佳的条件存在,primer也是一个需要考量的条件,
(比如说primer 的浓度低,是可以有效降低primer dimer的问题...
不过这是不得已的解决办法...)
关键在於一般像QPCR这种相当敏感的实验来说..
您的positive control及negative control能不能有效证明您的实验是合理的,
才是重点!
如果之前没有设定的话
您就重新各设定一个positive control及negative control来证明...
若依我不负责任的说法...我倒觉得根本没差多少,只是最低浓度的二分之一?
论文中明确着明方法即可...
※ 引述《candy315 (沉淀)》之铭言:
: 各位大大好,我是某大学的硕士生
: 我想请教关於real-time PCR的问题
: 大部份的实验...都会用RNA转cDNA然後再做real-time PCR
: 但我的template是genomic DNA
: 也有听说genomic DNA的real-time比较不好做..
: 然後,一个大问题来了
: 我们老板说,primer的量通常是总体积的1/10左右
: 所以我先用一般PCR在测试primer时,我是用5uM的primer,然後每管取2.5ul
: (total volumn为25ul)
: 但做real-time时,因为我阴错阳差的失误
: 一直以来,我都是用5um的primer,然後每管加0.25ul
: (total volumn亦为25ul)
: 我想请问大家,有人用过这麽少量的primer吗??
: 因为我的实验其实已经快结束了...如果我之前的primer量真的加的太少,
: 那我可能所有实验要重做了....orz
: 所以我想请问各位有经验的大大,有人也是和我一样,用类似的量做real-time PCR的吗
: PS,我用的kit是 SYBR的kit
--
幸运是每个人都会有的,
但幸福只给予一直不停追求着的人。
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 118.169.193.200
1F:推 epoch:好文 帮转Biotech^^ 03/26 09:40
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.130.5