作者HIbaby (嗨北鼻)
看板Biotech
标题[转录]Re: 请问生物常识
时间Sat Sep 29 16:07:20 2007
※ [本文转录自 Biology 看板]
作者: biolenz (lenz) 看板: Biology
标题: Re: 请问生物常识
时间: Sat Sep 29 06:20:55 2007
我老是喜欢回这种问题，我想是因为发挥空间大一点吧 XD
※ 引述《scal (THE YANKEES)》之铭言：
: 请问各位 我在杂志上看到 现在有些科计
^^^^
的确，在 Nature，Science 与 PNAS 这些杂志上呢，有这麽一些新的科技，
可以更快速地 "决定 DNA 的长度"，我想你这里的意思应该是 "定序"。
否则长度跑胶不就得知？
: 是可以用更快速的方法决定DNA的长度
: 我的问题是 问甚麽要知道DNA的长度呢?
: 谢谢
假设你问的是定序的话，那现今的方式多数使用 PCR (polymerase chain reaction)
材料丢进去，放在一个控温器里头就可以进行了，然後跑胶，就可以测知序列。
虽然已经很快，但是因为有一些些麻烦，所以有些人研究了新的定序方法。
有 review 的 paper
"Emerging technologies in DNA sequencing"
可以自己 google 找一下
主要新发展的技术举列如下
1. 奈米孔定序法 (Nanopore sequencing)
2. 焦磷酸定序法 (Pyrosequencing)
(这已经商品化了)
奈米孔定序法的杂志文章标题为
Characterization of individual polynucleotide
molecules using a membrane channel
意思是让单股的 RNA 或是 DNA 穿过ㄧ个膜的孔洞，穿过孔洞时，
因为 ATCG 结构的不同。会导致该孔洞电位的改变。这些电位改变的资讯可以
转化为 ATCG 从而达成定序。原理上只要有一条 RNA 或是 DNA 就可以定序得到。
而且前处理只要将 DNA 弄成单股即可，不过正在发展当中，有兴趣利用
Nanopore sequencing 为关键字去搜寻看看，图解说明如下：
http://tinyurl.com/yqvc7k
焦磷酸定序法则是利用 DNA 合成时会放出一个 PiPi 的特性，加入与 PiPi 反应
会产生萤光的物质，则当我依序投入 ACTG 到反应中时，唯有正确的序列才会
有萤光反应，藉此定序。已商品化，国内有些学校已经有了。
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◆ From: 140.127.160.142
※ 编辑: biolenz 来自: 140.127.160.142 (09/29 06:22)
1F：推 microball:推~ 09/29 10:54
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 133.11.50.150
2F：推 Highwind:第二种呀..不是只能定小片段,像侦测SNP,长片段应该很慢 09/29 16:38
4F：推 enisx:早有定序仪运用pyrosequencing 第二个连结是原理的动画 09/29 20:29
5F：推 Highwind:喔,这是genome scale的定序,层级果然有差 09/29 22:56