作者note0817 (期待...)
看板Biotech
标题[问题] 序列比对问题
时间Wed Sep 12 14:32:01 2007
请问在比对序列时，有办法直接给一个序列去资料库寻找，
然後找到跟它同源性高的序列，而且直接将这些序列放在
一起比对吗?
例如:
A菌(我提供之序列)DFGAY ASFTG SDFGY................
B DTVGB HJMKU SDFGH................
C IUKKJ UYTIU IUYKJ................
. .................................
. .................................
Z .................................
(B~Z为与A相同之酵素只是来源不同，後面残基纯粹乱打)
我最多只能看到
A与B比，A与C比，A与Z比等...
而我想要的是ABCDE....Z一起比!
希望大家看的懂= =
请问有高手可以帮忙解答吗?
感激不尽
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.121.156.71
1F：推 oxoox:你要比的是蛋白质还是DNA 我只知道比DNA的 09/12 20:57
2F：推 runpapa0520:BLAST完，你得自己把分数最高的存一存吧，再用软体比 09/12 21:32
3F：推 lingon:BLAST, take the top hits and do MSA by clustalw 09/13 00:02
4F：推 note0817:我是想说有没有一步骤就能完成的~看来是没有!感谢! 09/13 09:59
5F：推 note0817:那请问怎样叫做分数高? 09/13 10:04
6F：推 elgase:score值,相似度越高数值越大 09/13 10:05
7F：推 mzac1b:看起来好像你要做multiple sequence aligment? 09/14 19:58