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标 题Re: [问题] DNA ladder实验
发信站不良牛牧场 (Wed Aug 22 10:46:59 2007)
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※ 引述《[email protected] (Koilocytosis)》之铭言:
: 实验方法
: 3x10^6个细胞以200uM, 500uM, 1mM H2O2处理六小时
: (paper上说可诱发凋亡, 也可见到DNA ladder)
: 用TRI reagent抽DNA (方法:http://www.mrcgene.com/tri.htm).
: 最後加入20uL水将DNA回溶,
: 但因前一步骤的酒精没有挥发的很完全, 所以总溶液体积约为40-60uL
: 取一半(30uL)样品, 加上dye混合之後就跑1.2%琼脂电泳
: 实验结果
: 之前用这方法抽DNA所测出OD约为1.4-1.7
: 在1200bp上方(也就是分子量>1200bp)有两条band, 下方则是很淡smear的样子.
: 我的问题
: 我想请问版上是否有高手用过TRI reagent抽DNA, 并观察其DNA ladder情形呢?
: 我不晓得是DNA没抽成功呢? 还是每个well放的量太少, 所以看不到ladder的样子呢
: 麻烦请版上高手为我解惑呀!! 感激不尽! ^^*
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1.经验上跟cell type有很大的关系..有些cell跑出来的pattern很容易是smear-like,
不过这在发表时是可以被接受的.
2.你有测纯度..那应该也同时有测浓度吧..所以你的loading量是多少呢??
or more information about your running condition..?
3.H2O2的保存是老问题..它常常因保存不好而不work..有确定H2O2是ok的吗??
or 能造成DNA ladder的试剂很多,是否可能用其他reagent来induce?
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