作者dankai (改变心态...冲!)
看板Biotech
标题Re: [求救] 植物DNA的萃取
时间Sun Jul 29 13:55:50 2007
※ 引述《odones (天空)》之铭言:
: 最近要抽植物的Genomic DNA
: 可是一直不顺跑电永都是smear的情况
: 把protocol列出来希望有大大可以给予指教
: 谢谢
: 1. CTAB 500贡ul + beta-me 40 ul 预热65℃ 30 min
: 2. 液态氮研磨植物叶片加入(1)水浴65℃ 2 hr
: 3. 加入chloroform/isoamyl 24:1 500汹ul,倒转tube 100次,离心8000 rpm 10min
: 4. 吸取上清液到新tube,加入chloroform/isoamyl 24:1 500 ul,倒转tube 100次,离心8000 rpm 10min,共三次
: 5. 加入isopropanol 500ul,放至-20℃ overnight
: 6. 离心8000 rpm 10min,4℃,去上清液晾乾
: 7. 加入TE buffer 500ul 弹至全溶(tip可切斜口)
: 8. 加入RNase 5汹ul,37℃ 30min
: 9. 加入isopropanol 500 ul,放至-20℃ 30min
: 10. 离心8000 rpm 10min去除上清液
: 11. 70%酒精wash 2次,晾乾
: 12. 加入TE buffer 200 ul,测OD,跑电泳
1.你在把研磨好的植物材料放到CTAB时,可能潮解到 (我初期做实验时有发生过)
2.会不会你的植物材料的次级代谢物太多,遮光不足等 (像我的材料会额外加入PVPP)
3.水浴的时间....我是不清楚你是看paper还是前人留下来的方法...我是觉得煮太久了
4.我建议你再第7步骤後再细纯化一次利用phenol与chloroform...
因为我觉得你这个纯化方法算是粗纯化而已...在最後的DNA中仍存在许多杂质~如蛋白质
5.(tip可切斜口)<-----这个步骤很危险...原本灭菌好的tip..可能切的动作污染!
6.你可以将RNase作用时间再延长至1个小时...让他充分作用
7.我想最终还是你的TE buffer是不是已经污染等等~
其实再第一次TE buffer溶完时,就可以先跑一次电泳...
如果这时候已经smear就知道之前步骤出出问题了
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◢ ◣ 吼~
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◆ From: 140.127.29.80
1F:推 alaric:为什麽不先切好有斜口的tip再去灭菌? 07/29 14:02