作者norabbc (累到快被鬼拖走...)
看板Biotech
标题找限制脢切位
时间Tue Jul 17 18:35:46 2007
我用引子上ncbi比对後
出来的不是我的菌株名 可是paper上是这样写的
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on
我用blastn比对序列 打primer上去(上面是网址 不会缩 报歉喔!!)
f:5'-agagtttgatcctggctcag-3'
r:5'-gctgcctcccgtaggagt-3'
出来的是他完整的基因序列
(确没有paper上的E.coli，staphylococcus，streptococcus，kp等等)
那我在用搜寻 想找到我primer确实夹到的片段 大小约330bp)
该怎麽操作呢??
paper上菌株的accession number为NC 00913
不知道该如何用Acession number找出菌株呢?
那找这个PCR产物的限制脢切位点又该如何找呢??
我之前试过Alu 1 但切出来片段太小
想找到没切出这麽多的
拜托板上高手了 拜托!
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