作者tear2001 ( Play ball !!)
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标题[请益] 关於Evolutionary Rate的计算
时间Sat Jun 23 15:06:34 2007
※ [本文转录自 Biology 看板]
作者: tear2001 ( Play ball !!) 站内: Biology
标题: [请益] 关於Evolutionary Rate的计算
时间: Fri Jun 22 23:07:32 2007
由於小弟刚从network biology相关范畴转到evolution这一方面相关研究
目前现行比较常用的evolutionary rate之计算方法似乎是dS/dN的计算
而这方面也有套件paml可以使用 dS/dN的计算需要align好的DNA or RNA sequence
但由於小弟手中只有amino acid sequence而不是nucleotide sequence
想请教一下板上曾经或是正在做相关研究的大大
有没有哪一种理论是只利用amino acid sequence就能测出evolutionary rate的方法?
希望能给一些提点或是关键字串好让我去搜寻
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