作者aggaci (reject！又reject！)
看板Biotech
标题Re: 请问screen DNA-binding protein的方法?
时间Thu Jun 14 22:19:02 2007
※ 引述《[email protected] (JUAN)》之铭言：
: ※ 引述《[email protected] (类比设置)》之铭言：
: > 我现在已经有一段potential promoter region
: > 接着要找会bind这段region的transcriptional factor
: > 请问有什麽方法可以用呢?
: > 可以用EMSA去跑 (nuclear extract + DNA fragment)
: > 然後再把会binding的shft band挖下来 纯化 然後去打mass吗?
: 理论是可行的
: 实际上有点辛苦
: 因为这麽做的蛋白质的量实在很少
: 每次ID都找到keratin
: 就算找到一个TF
: 是不是真的 也要大费周章去确认
: 你最好现在是博一….
理论上可行，但是有困难
倒不如跑DAPA再监定，这样还是很麻烦
最好的方法是先predict可能是哪些TF再用竞争的实验验证
最後用抗体去做supershift...运气好的话很快就有结果
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