作者kotenka (Egg Dance)
看板Biotech
标题[问题] 关於检测突变的方法
时间Wed Jun 13 06:28:12 2007
这两天念一篇paper,是要看cancer cell mitochondrial DNA突变
(ND4 mutation in transitional cell carcinoma: Does mitochondrial mutation
occur before tumorigenesis? C.Y. Tzen,Mitochondrion,2007,273-278)
作者用了三种方法来检查:
DNA sequencing
RFLP
DHPLC(denaturing HPLC)
而文中提到,三种方法的sensitivity是定序最低,RFLP其次,DHPLC最高
我想,sensitivity是指只需少量sample就能有结果吧
a.但如果在知道mtDNA序列的情况下,用PCR放大不就没有sensitivity高低的疑虑
还有,既然要找突变,那检查的正确性应该比较重要
我以为定序应该最正确,因为两个序列一对马上就知道哪里突变了
b.问了朋友,说定序很容易出错,但他也不会解释,请问是为什麽呢?
然後这个朋友一直跟我说,和定序相比,RFLP就可靠多了
c.但我觉得,要是突变不是发生在切位上的话根本就检查不出来阿,怎麽会比较正确?
三种方法都只是学过原理,并没有实际操作过的经验
以上共三个问题,麻烦懂的人解答了,谢谢!...
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