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标 题Re: [问题] 关於NCBI的BLASTn之後的一些资料/数据
发信站清华生命科学 BBS (Wed May 30 23:18:45 2007)
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※ 引述《[email protected] (讨厌失眠)》之铭言:
> 各位高手大家好
> 我在做"细菌菌种监定"的实验
> 主要步骤是提取total DNA 然後PCR夹出16S rRNA gene然後去BLAST 监定到"属"或"种"
> 我将定序出来的结果到BLASTn去输入
> 出来了一些资料包括max score, total score, query coverage, E value, max ident..
> 等等
> 请问分别都代表什麽意思呢
> "同源性最高的"应该是哪个数值最大或最小呢?
> 我原本以为是max ident百分之百的 就是我要的结果
> 可是那个百分之百的score佑是最低的@@
> 抱歉我们老师也不太会
> 所以我只能上来问问各位高手
> 请大家帮忙 感恩
> ~
> ~
你的老师不是太混就是懒得理你
max identity 100%就是你要的
但是如果你输入序列太短
最好也看一下 E值 越接近0越是你要的
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※ Origin: 生命科学 BBS <bbs.life.nthu.edu.tw>
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