作者YuDavid (讨厌失眠)
看板Biotech
标题[问题] 关於NCBI的BLASTn之後的一些资料/数据
时间Mon May 28 01:15:04 2007
各位高手大家好
我在做"细菌菌种监定"的实验
主要步骤是提取total DNA 然後PCR夹出16S rRNA gene然後去BLAST 监定到"属"或"种"
我将定序出来的结果到BLASTn去输入
出来了一些资料包括max score, total score, query coverage, E value, max ident..
等等
请问分别都代表什麽意思呢
"同源性最高的"应该是哪个数值最大或最小呢?
我原本以为是max ident百分之百的 就是我要的结果
可是那个百分之百的score佑是最低的@@
抱歉我们老师也不太会
所以我只能上来问问各位高手
请大家帮忙 感恩
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 123.112.22.252
1F：推 nightcatman:hit太短的话,即使是ident 100%, score也不会太高 05/28 01:41
2F：→ nightcatman:要简单判断可以看score(越高越好)或E-value(越低越好) 05/28 01:42