作者ppta (幸福的瞬间)
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标题Re: [求救] 怎麽做都做不出来..............
时间Wed May 23 01:43:54 2007
: : 来改其他的条件。有杂band没关系,天知道我多想看一看杂band来改进啊。
: 一般应该是看primer的Tm值决定吧
: 通常使用Tm-5度
: 取两个primer中Tm比较低的那个来计算
: 如果做不出来就再减5度
哇,如果做不出来,tm低的减到10度都会变成四十多度了耶,真的可以吗?可以的话我要
冲了。
: 有没有考虑过其他的问题?
: ex.primer dimer
我的确一直有这个问题,是因为加过量吗?加过量会造成做不出来吗?如果是说引子会互
黏,真的会吗?因为我都是参考paper来订的耶。
serotonin transporter的primer
5-GGC GTT GCC GCT CTG AAT GC-3 and 5-GAG GGA
CTG AGC TGG ACA ACC A-3).
产物大小预计五百多bp
gc content:61.9%
tm1个是59.7度,
另一个
gc content 65%
tm是62.3度
drd3
5 -
GCT CTA TCTCCA ACT CTC ACA-3 , reverse primer: 5 -AAG TCT ACT CAC CTC
CAG GTA-3
产物大小462bp
gc content47.6%
tm53.5
另一个gc content47.6%
tn54.2
tph
forward primer, 5-
TTCAGATCCCTTCTTCTATACCCCAGA-3; reverse
primer, 5-GGACATGACCTAAGAGTTCATGGCA-3.
产物大小918bp
gc content48%
tn58.6
另一个
gc content 44.4%
tm58.6
: 另外请问一下你的产物大小预计是多少?
: 你的template是什麽?(plasmid? genome?)
template是口腔绵棒粹取出来的,应该是genome吧。
: 还有你写DNA没定量
: 有时候DNA的量、copy数都会影响PCR成功与否
我的DNA都是别人测试过夹得出东西的,
我自己也有夹出一个基因,这样还会是DNA浓度的问题吗?
: 最好还是定一下量比较好
: 你说paper写annealing温度55
: 意思是说你的primer是和那篇paper使用的primer一样吗?
: 那麽我觉得annealing温度应该不是问题
: 照他的55度应该做的出来
我的条件全都按照paper来做的。只是我这两周都直接降到50度,因为我先前都是按照
paper的温度有做成功一、两次(做几十次吧,而且超弱),後来再也做不出来,现在
乾脆全降到五十度,想说先做出杂band再来升温度,结果还是做不出来。
: 你的问题可能在template的取得、酵素的好坏(有时候酵素会坏掉)
: 会是其他问题
dna是近一个月学弟刚萃完而且夹他的基因超亮的,我也有分装,这几天把buffer、taq
dntp都换掉,还是没有。
: 也有可能你的template中根本没有那个基因??
应该不可能,这些基因每个人都有,这些基因是人类很有名的基因,跟犯罪有关的基因。
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◆ From: 203.71.2.194
1F:推 xenopus:什麽基因和"犯罪"相关啊? 05/23 09:58
2F:推 ppta:多巴胺、血清素、正肾上腺素系统都和攻击暴力、冲动等行为有 05/23 14:50
3F:→ ppta:关,有兴趣能搜寻一下MAOA 暴力,这是比较有名的 05/23 14:51
4F:推 b46006:加pcr enhancer试试 例如10% glycerol 05/23 19:19