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标 题Re: [请益] 关於基因专一性探针的问题(gene-specif …
发信站清华生命科学 BBS (Fri May 4 21:27:59 2007)
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※ 引述《[email protected] (小次郎)》之铭言：
> ※ [本文转录自 Biology 看板]
> 作者: transmore (小次郎) 看板: Biology
> 标题: [请益] 关於基因专一性探针的问题(gene-specific probe)
> 时间: Mon Apr 30 22:05:46 2007
> 因为实验的需要
> 我要设计专一性的探针
> 用来分离、确认相似度非常高的基因(植物的gene family)
> 相似度高到约1000bp的基因只有约5个mer的差别
> 要找出大片段的差异区来设计probe是不可能的
> 但是如果在20bp的区域中有两个mer的差异
> 这样的probe能分辨不同的基因吗?
> 举例来说
> 如果我有两段序列如下
> 1.***********GATGGTAGAGTGATACAGAC****************
> 2.***********GATGATAGAGTGATTCAGAC****************
> ^ ^
> *表示完全相同的序列
> 如果我设计的probe是与1号序列完全配对的20个mer
> 用这样的probe去筛选时
> 会黏到2号序列吗?
> 又..如果会黏
> 我加高wash的温度..可以让他从2号序列洗下但还是黏在1号序列上吗
> 如果加高温度是可行的
当然是可以的
用计算去求Tm只能参考
因为会受盐浓度影响
比较精确的方法是去跑real time PCR
这种机器有分析DNA Tm的功能
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※ Origin: 生命科学 BBS <bbs.life.nthu.edu.tw>
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