作者ColdP (......)
看板Biotech
标题[问题] 请问一下有用磁珠作IP的经验的人
时间Tue May 1 01:36:47 2007
我之前在用New England biolabs的protein G磁珠作IP
刚开始的时候还满顺利的,
有些抗体真能抓到东西,
而且在negative control中(只有sample和bead),
不会elute出任何东西......
但是不晓得为什麽,
最近我重复之前的实验,
却不知为何开始出现问题了 囧>
我的negative control中开始出现大量的non-specific binding,
出来的pattern居然还和我的实验组有些类似,
这样我不由地开始有些怀疑之前得到的结果了...
我仔细地翻阅了一遍自己之前的实验记录和data,
老实说我现在的IP作法和之前的IP作法基本上是一样的,
但是我以前的negative control可说是相当乾净,
现在的negative control却相当脏...
真要说作法有什麽不同,
大概也只有我现在是用reuse的bead作preclear(不然太浪费了),
还有我刚作的时候没有加入PIs(pepstatin A, leupeptin, benzamidine, PMSF)
这些有可能是原因吗?
补充比较细节的部分,我用的IP buffer类似RIPA buffer:
10 mM Na2HPO4, 200 mM NaCl, 10 mM EDTA, 0.1% SDS, 0.5% NP-40, pH 6.3
wash次数为三次,都是用IP buffer进行wash, 基本上wash到第三次就已经
wash 不出什麽东西了....
elution buffer是0.05M diethylamine, 0.5% deoxycholate, pH 11.5.
老实说我都用了这麽强的IP buffer,
居然还会在negative control 看到non-specific binding实在让我很吃惊 <囧>
由於整个实验室就只有我在作这个东西,
老板对於这样的现象也不知道为何会如此,
希望有经验的版友能够分享一下可能的原因....
谢谢!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.114.96.73
1F:推 ldy:可能是reuse的beads. 05/01 11:25
2F:推 likelego:有可能是reuse 的没洗乾净,有残留。 05/02 17:10
3F:推 ColdP:谢谢... 後来我用全新的bead重新pre-clear 果然大部分的 05/03 00:56
4F:→ ColdP:的non-specific binding都消失了. 05/03 00:57