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标 题Re: [问题] long range PCR
发信站新绿园 (Sat Apr 28 17:29:38 2007)
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※ 引述《[email protected] (keep the faith)》之铭言:
> ───────────────────────────────────────
> 最近要做long range PCR
> 想请问大家哪一家的Taq比较适合做long range PCR
> 是不是有proofreading...
> 也请大家提供点意见
> 没夹过500bp以上的说...有点给它害怕
> 夹个10K成吗?
> 平均成功的机率多少
> 我要夹human genomic DNA说...
> 感谢大家的大力协助...
1.target DNA的copy number要够多(1 microgram)一定做的出来,且quality要好!
若copy number确实不太够,可添加BSA(cosolvent)会有所帮助!
2.可使用hot start 的方法,比较specific!
3. polymerase要选择processivity较长的!pfu就比Taq好
或者可以使用mix的polymerase(Taq+pfu),可以选购mix的产品!
4. 可添加cosolvent to assist denaturing complete ,如10% DMSO
另外可以加pyrophasphatase它能将phosphate分解可促进反应的进行!
5. cycling parameter中, denaturating and extension的反应时间要够长!
denaturating--> genomic DNA:5 min; plasmid DNA:2 min
extension-->一般taq:1kb/min;所以根据你欲amplify的10K就要用最少10 min
掌握这些原则做看看,希望能对你有所帮助!
有人最多有amplify出19.6K的啦!
10K应该ok ok
good luck!
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