作者aggaci (reject!又reject!)
看板Biotech
标题Re: [问题] EMSA做不出supershift
时间Tue Apr 17 22:40:41 2007
※ 引述《lysa (上台北了)》之铭言:
: ※ 引述《aggaci (reject!又reject!)》之铭言:
: : 先确定你的AB可以作EMSA
: : ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
: 我买的Ab是sc-186x,所以应该是可以做EMSA的
你如何知道呢?satacruz的datasheet不准,他每只都说可以
: positive control
: : 用CREB铁定会binding的probe作EMSA,再测试Ab能否supershift成功
: ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
: 这我不太懂,要怎麽确定这probe是creb一定可以binding的?不是要用Ab check吗?
如PAPER已经发表的确定此段DNA CREB一定可以binding
或是你用的competitor 你不是说你有CREB的oligonucleotide吗?
positive control?懂吗?
举个例子
若此CREB probe(当positive control)可以supershift成功
但你的probe不行 纳表示你的probe可能不是CREB结合在上面
请节哀
若两组都不行,那表示你supershift条件没抓到,或抗体有问题
通常supershift我习惯买两支不一样的抗体来作
以避免某些protein不是抓不到而是被挡到了
: : 看PAPER用这只抗体都是用什麽条件?
: : 先加抗体?後加抗体?跟probe一起加?放冰上吗?
: paper看过了...所有的情况都有试过.....包括前加後加抗体,室温下或冰上等
: 我想再请问板上的EMSA达人,在binding的过程中
: 有没有先加cold probe会有差别吗?
: 我都是cold probe跟hot probe同时加的...
: 还有请问有专门写EMSA的专书吗???
: 因为我不是读分生本科系出来的
: 很多都很不懂。。。麻烦请大家解答罗!!谢谢!!
先加的倍数会比较低10x-50x
一起加的倍数较高 100x-1000x都有
一样,竞争的实验negative & positive control都要有!
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※ 编辑: aggaci 来自: 140.114.100.165 (04/17 22:42)