作者liuse (充实自己,提昇自己)
看板Biotech
标题Re: [问题] 请问用western blot侦测磷酸化蛋白
时间Tue Apr 17 14:39:48 2007
※ 引述《fodo (fodo)》之铭言:
: ※ 引述《liuse (充实自己,提昇自己)》之铭言:
: : 请问你是要detect cellular protein phosphorylation
: : 还是IP kinase来进行kinase assay
: : 可以讲详细一点嘛
: : 还有你用的抗体是染啥
: : 染protein还是染phospho-Y(phospho-S/T)?
: : 还是特别染phospho-specific residue on kinase?
: : 你可以讲详细一点
: : 包括你的目的,使用的materials 和tools
: : 这样比较好给意见
: 谢谢您的解释
: 我的实验目的是利用病毒感染细胞株後所引发的宿主讯息传递路径,
: 希望能找出过程中有哪些protein kinase发生磷酸化。
: 所使用的方法是,病毒感染後直接收取cell lysate,
: 先用western blotting detect 有哪些protien 被磷酸化,
: 因此使用anti-phosphotyrosine or anti-phosphoserine/threonine的Ab,分别进行。
: 看跑出来的结果观察到哪些分子量的位置有被磷酸化,
: 再往下一步去翻paper找可能的cadidates,再用spcific phospho- Ab来筛选。
: 例如用anti-phosphotyrosine Ab跑出来的western blotting,在60kDa的位置有变化,
: 接着再用同样的sample再跑一次胶,
: 用anti-phospho-src(Tyr416)的Ab去染western blotting,看结果吻不吻合。
: 现在遇到的问题是在同样一批sample,
: 用anti-phospho-src(Tyr416) Ab染western blotting时,可以看到有感染才有磷酸化,
: 但是隔天想要立刻重复,一样的condition重新收一批sample,
: 一样用同一只Ab,却又看不到磷酸化。
: 可能隔几天再收,再跑,磷酸根又被我看到了,
So I think you should have the control to confirm that the virus infection
is successful and efficient.
简单来讲 你必须做一个control去证明你的infection是成功的且efficiency高
这边可能就要你自己查查看了
看你用的virus再infect cells後有哪些已知的protein level会改变
就可以用来当marker
另外,如果担心在操作过程中phosphate掉掉
inhibitor就加多一点罗
: 就一直重复在"你看得到我~~嘿嘿!!你又看不到我了~~"的循环里。
有时候实验都会这样
仔细回想看看几次处理到底有哪些细微部分不同
或许可能就是原因
: 跑胶用13x14cm的大型电泳,跑的protein量应该足够。
: 我家老板觉得,看到磷酸化的那几次,是病毒跟细胞刚好都调整到绝佳状态,XD
: 不过我一直认为是我操作手法上出了问题,结果才会这麽不稳定。
: 希望有经验的学长姐可以提供一些意见,谢谢你们
也许你也可以试试一次实验就做multi-repeat
在一次实验中重复做个两到三组
加油
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◆ From: 140.112.135.131
1F:推 fodo:谢谢各位给的意见,我会再继续试试看的... 04/17 19:37