作者liuse (充实自己,提昇自己)
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标题Re: [问题] 请问用western blot侦测磷酸化蛋白
时间Tue Apr 17 03:29:45 2007
※ 引述《fodo (fodo)》之铭言:
: 请问使用western blot侦测phosphorylated protein kinase时
: 每次跑出来的结果很不稳定,有时候可以看到磷酸化现象,有时候又看不到
: 不知道是在那个步骤出了差错?
请问你是要detect cellular protein phosphorylation
还是IP kinase来进行kinase assay
可以讲详细一点嘛
还有你用的抗体是染啥
染protein还是染phospho-Y(phospho-S/T)?
还是特别染phospho-specific residue on kinase?
: =============================================================================
: 自己觉得可能发生问题的地方
: [1] lysis buffer成份
: 我所用的RIPA buffer为(50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.5mM EDTA,
: 1mM DTT, 1% NP-40, 0.5% Sodium Deoxycholate,0.1% SDS)
: 使用前外加 protease inhibitor和phosphotase inhibitor
: 这个配方是kinase activity assay kit里面里面建议的RIPA配方
: 但是又有看到有资料上写说进行kinase assay时不可加入Sodium Deoxycholate
: 不知道是不是我加了什麽不该加的东西呢?
: [2] SDS干扰
: 会不会因为SDS-PAGE里面的SDS把所有蛋白都加上了负电,
: 如果要看的蛋白分子量太大,多了一个磷酸根跟没有多磷酸根,将无法被分辨
: 我要看的蛋白是Src kinase(~60kDa)和ERK(~42kDa)
: 这两种蛋白需要跑non-denature gel吗?
这是不需要的
不用担心
: 查paper作磷酸化很多人也是用SDS-PGAE在跑
: [3] 温度影响
: 收完cell lysate後,每100ul加入2.5ul的β-mercaptoethenol,100℃煮10 min
: 每次要跑胶前再煮100℃ 2 min
: 这样会boiling过头吗? 莫非磷酸跟会煮一煮就掉下来吗XD
covelant bond没那麽弱
不用担心
: 我是实验室第一个作磷酸化实验的
: 作了好几个月都一直这样若有似无
: 不知道一般作磷酸化还有哪些地方是影响结果关键的步骤
: 想请各位有经验的学长姐提供我可以改善的地方
: 谢谢各位^^
你可以讲详细一点
包括你的目的,使用的materials 和tools
这样比较好给意见
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