作者fodo (fodo)
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标题[问题] 请问用western blot侦测磷酸化蛋白
时间Mon Apr 16 20:11:45 2007
请问使用western blot侦测phosphorylated protein kinase时
每次跑出来的结果很不稳定,有时候可以看到磷酸化现象,有时候又看不到
不知道是在那个步骤出了差错?
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自己觉得可能发生问题的地方
[1] lysis buffer成份
我所用的RIPA buffer为(50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.5mM EDTA,
1mM DTT, 1% NP-40, 0.5% Sodium Deoxycholate,0.1% SDS)
使用前外加 protease inhibitor和phosphotase inhibitor
这个配方是kinase activity assay kit里面里面建议的RIPA配方
但是又有看到有资料上写说进行kinase assay时不可加入Sodium Deoxycholate
不知道是不是我加了什麽不该加的东西呢?
[2] SDS干扰
会不会因为SDS-PAGE里面的SDS把所有蛋白都加上了负电,
如果要看的蛋白分子量太大,多了一个磷酸根跟没有多磷酸根,将无法被分辨
我要看的蛋白是Src kinase(~60kDa)和ERK(~42kDa)
这两种蛋白需要跑non-denature gel吗?
查paper作磷酸化很多人也是用SDS-PGAE在跑
[3] 温度影响
收完cell lysate後,每100ul加入2.5ul的β-mercaptoethenol,100℃煮10 min
每次要跑胶前再煮100℃ 2 min
这样会boiling过头吗? 莫非磷酸跟会煮一煮就掉下来吗XD
我是实验室第一个作磷酸化实验的
作了好几个月都一直这样若有似无
不知道一般作磷酸化还有哪些地方是影响结果关键的步骤
想请各位有经验的学长姐提供我可以改善的地方
谢谢各位^^
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