作者EROICAA (远道者)
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标题Re: [问题] western blotting!! 常抽到DNA!!造成拖 …
时间Mon Apr 16 03:48:37 2007
※ 引述《killmebaby (不错喔)》之铭言:
: 最近做western blotting时,不知到是cell lysate处理的不好,还是怎样,都会抽到DNA,
: 造成在跑SDS-PAGE时,都会看到明显的拖带现象..
: 试过离心多次一点,或是lysis buffer加多一点,但好像都没有改善,还是会随机的
: 抽到DNA.
: 可以请大家告诉我几个方法吗?快被这一点搞昏了....
: 谢谢大家!!
: 我的protocol:
: 1.using cold DPBS to collect cell
: 2.RIPA lysis buffer(我怕说是不是太强,打破核膜,才会拿到大量的DNA,因为我们
: lab要看细胞膜上的蛋白质,所以lysis buffer要强一点)
有sonication 就不用再去担心有没有打破核膜的问题
还有要看的如果是膜蛋白,应该有比RIPA 更好的配方
RIPA其实是最适合看细胞质内soluble protein的
: 3.加lysis buffer to cell pellet(我大约都加150ul/(3*10)6 cell
: 4. vortex 2 minor longer
: 5. sonication 5 min
如果你很确定拖带的现象是DNA造成的
那sonication 就是关键
我看过很多sonication 的protocol
都是几分钟... 或多少怎样(视机器)的设定几次的
这实在是非常奇怪的一件事
每次收集到的样本不一样、浓度不同
sonication 要做的份量也就不一样
sonication 真的抓到点,整个振动的感觉都会很不一样
而且不一定会有(通常不会有)很大的噪音
sonication 有没有完全要看你振的过程和结束後solution 的感觉而定
这不是很适合用文字说明... 有人带你作比较容易
真正有做好sonication 的solution,对着光看,在手上晃动几下就可以确认
另外一个band 不够compact 的常见原因是制胶原料的品质
原因可已有很多种可能,而其中最常见的就是常被忽略的APS
(我还有看过pH 没调好 or 放太久跑掉的例子,那真是够Orz)
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年 轻 的 旅 人 之 歌:
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◆ From: 62.160.12.19