作者aggaci (reject!又reject!)
看板Biotech
标题Re: [问题] western blotting!! 常抽到DNA!!造成拖 …
时间Sat Apr 14 23:16:48 2007
※ 引述《killmebaby (不错喔)》之铭言:
: 最近做western blotting时,不知到是cell lysate处理的不好,还是怎样,都会抽到DNA,
: 造成在跑SDS-PAGE时,都会看到明显的拖带现象..
: 试过离心多次一点,或是lysis buffer加多一点,但好像都没有改善,还是会随机的
: 抽到DNA.
: 可以请大家告诉我几个方法吗?快被这一点搞昏了....
: 谢谢大家!!
: 我的protocol:
: 1.using cold DPBS to collect cell
: 2.RIPA lysis buffer(我怕说是不是太强,打破核膜,才会拿到大量的DNA,因为我们
: lab要看细胞膜上的蛋白质,所以lysis buffer要强一点)
: 3.加lysis buffer to cell pellet(我大约都加150ul/(3*10)6 cell
: 4. vortex 2 minor longer
: 5. sonication 5 min
: 6. 4度C 离心 13200 rpm or 16100 rcf , 10 min
: 7. transfer supernatant(原液) to new microtube
: 8. protein定量 (原液在取时有vortex,怕取不准)
: 9. 再次将原液离心,4度C 离心 13200 rpm or 16100 rcf , 10 min
: 10.搭配lysis buffer将原液稀释到一定量(approximate 80 ug/well),这次原液离心
: 第二次完,取出稀释时,没有vortex
: 11.加入sample buffer & DTT, 沸水中煮3 min
: 12.煮完後,直接loading
: 13.160V, 1hr (此时就看运气了,有时很好,有时就会拖带很明显)
: P.S 我想应该不是胶的问题,我是用现成的, Invitrogen NuPage
: ..希望大家帮我看看错再哪了..谢谢大家
你这个方法是看total cell protein吧?而你说想看细胞膜的蛋白?
你应该去买专门抽膜蛋白的kit PIERCE有
也许会贵点,但是你连PAGE都用现成的,我想这KIT对你们应该不会太贵!
另外,你说会拖?你是不是overloading了?
因为你都sonication了,DNA大都被你打成小片段了,应该不会造成问题!
还有sonication稍久了些
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.114.100.165
※ 编辑: aggaci 来自: 140.114.100.165 (04/14 23:18)