作者llorraine (该醒了)
看板Biotech
标题Re: [问题] 请问ligation的一些问题
时间Wed Apr 11 17:47:28 2007
※ 引述《[email protected] (我是废渣)》之铭言:
: 这边我是用NanoDrop去测的
: 也是分光光度计的一种
: 测出来的值就是怎麽高
: 所以我很怀疑他是假的
: 对了 我只用了0.5ul的酵素去切
: 跑胶 只出现一条band
: 此部分嘛
: 因为本实验室的人都怀疑纯化效果不好
: 你也看到了 我拿了果此多的dna量去做
: 所以依column的建议50ul的效果最好
: 所以我用两管 共是100ul
: 最後transformation前来个大浓缩
: 很明显 是打错了
: 是5ng/ul
: 我的估计指的是跑胶估计
: 後来有去测分光光度计上面那台
: 浓度是3ng/ul
: 所以效率明显不好
: 真怪
如果你认为一开始的DNA浓度就有错误
那也不能从最後的结果就认为效率不好
假设一开始有180ug的DNA 绝对不可能以0.5ul的enzyme切好
我自己切20ug 20U/ul的限制酵素就要加到4ul 才能切完全
因为限制酵素会随着时间及存放状态(甚至一直放-20也一样)而下降
就算是刚买来的 我也不会真的以1ug DNA对1U的酵素去切
谁知道这批酵素是多久以前做好的 在运送的过程有没有缺失
所以建议你还是把一开始的DNA浓度真实测量清楚 再来谈回收率
如果你觉得那台机器测出来的值不可靠 那就换一台测
甚至只采跑胶定量的浓度去相信(我的DNA量都只靠这个测 到目前也没有出过问题)
另外 做ligation的片段在精不在多 只要DNA够正确够纯
vector+insert只要50ng(个人习惯是30ng) 就可以成功ligate
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