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标 题Re: [问题] 请问ligation的一些问题
发信站新绿园 (Wed Apr 11 00:06:03 2007)
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※ 引述《[email protected] (蓄势待发)》之铭言:
> ───────────────────────────────────────
> 我觉得你的做法好像怪怪的
> : f大大
> : 可否请教一下您家都用什麽方式纯化吗
> : 因为我们家 都乱用 大家都觉得纯化效率很差
> : 目前我取60ul(3000ng/ul)的dna去切 (我强烈怀疑这个质是假的
> 这个DNA的量真的很多耶...总共有180ug呀...
> 那麽你是使用多少酵素去切呢
> 如果是NEB的EcoRI的话1ul是20U(印象中)
> 那麽需使用9ul的酵素???
这边我是用NanoDrop去测的
也是分光光度计的一种
测出来的值就是怎麽高
所以我很怀疑他是假的
对了 我只用了0.5ul的酵素去切
跑胶 只出现一条band
> : 但最後胶纯化後体积100ul
> 通常胶体纯化不会溶於这麽多水阿
> 为了让DNA的浓度提高
> 大概只会用30ul的水
此部分嘛
因为本实验室的人都怀疑纯化效果不好
你也看到了 我拿了果此多的dna量去做
所以依column的建议50ul的效果最好
所以我用两管 共是100ul
最後transformation前来个大浓缩
> : 浓度我估计只有5ug/ul 也就是我切了如此大量的dna却只回收到500ng左右
> DNA有两种定量方式
> 跑胶或是测OD
> 为什麽要自己估计阿
> 可以回收5ug/ul...这个量真的不是普通的高耶...
> 而且5ug/ul体积100ul那麽总共是500ug的DNA阿...不是500ng
很明显 是打错了
是5ng/ul
我的估计指的是跑胶估计
後来有去测分光光度计上面那台
浓度是3ng/ul
> 还有原本只有180ugDNA,为什麽纯化後有500ug的DNA啊
> 你是不是写错了???
> : 所以想请教一下f大 用了多少dna去切 用什麽方式纯化
> 如果是用column纯化的话
> 有最大量的限制
> 大概是40ug左右(厂牌不同会有所差异)
所以效率明显不好
真怪
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如果美丽必须成为过去
别忘了临走时
请将记忆装入行囊
顺便关上曾经为你而开的窗
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