作者EROICAA (远道者)
看板Biotech
标题Re: [求救] colony PCR有P到 但定序无结果
时间Fri Apr 6 06:42:12 2007
※ 引述《pan7353 (要变成自己喜欢的模样)》之铭言:
: 我想请问一下没有 transform 的 E.coli 哪来的阿 它不会长在 LBA 上 所以用 LB 养吗?
: 这个步骤是为了确认是不是 P 到 chromosome 吗?
随便放一点点(记得,真的要"一点点"!)transformation 用的
competent cell solution 在没有抗生素的agar plate 上就能得到一堆
: 4.我最後一次定序 就是用两端 M13 做 colony PCR 结果一样非常诡异
: 有 p 到两种片段 一种是预计大小的(快1000bp) 但是非常非常淡
: 另一种很粗很亮 但是不是预计大小的片段 比较小一点(600bp)
: 比我的insert(850bp)还小 但是又不到没有 insert 那麽小 (200bp)
: 我把有 p 到 1000bp 的送定序 恩 还是空的
: 然後我把用M13 P到两种不同片段的菌再用 insert 的 primer p一次
: 然後通通都有 850bp 的片段
这个描述听起来就是colony 同时有两种plasmid 的情况
(在假设那个1 kb 是正确product 而非non-specific product 的前提下)
只是我第一次听到这种正常size 的clone 也能有这种现象
而且size相差这麽小,没理由amplify 之後那个大的(也就是正确的)pladmid
就完全消失无踪 (....好吧,我承认我觉得那只是non-specific product)
你的vector only 这麽容易出现
倒不如留意看看enzyme digestion 和 de-phosphorylation 过程有没有做好
PCR 是个很sensitive 的反应,有时候一些杂讯也不要太钻牛角尖了
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勇敢的心,无畏无惧
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