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标 题Re: [求救] colony PCR有P到 但定序无结果
发信站新绿园 (Thu Apr 5 11:09:15 2007)
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※ 引述《[email protected] (skylawer)》之铭言:
> ───────────────────────────────────────
> ※ 引述《pan7353 (要变成自己喜欢的模样)》之铭言:
> : 不好意思 这个问题我其实已经问过一次了 但是还是没有解决
> : 我的 insert DNA 有 846bp(PCR 得到的)
> : 放到 yT&A 的 TA cloning vector 中(用 TA clone 接)
> : 蓝白筛选了六个 colony 做 PCR 结果都有 specific 的片段(用insert DNA的primer P)
> : 挑了四个 colony 送定序後 结果四个都没有 insert DNA 的序列
> : (用 vector 上的 M13 定序)
> : 甚至连当初做 colony PCR 的 primer 序列都没有
> : 我已经试过的方法
> : 1.换 pGEMT system 其他一样 无效(因为我怀疑 colony PCR P 到 vector 上其他序列)
> : 2.定序结果我有试过互补和反转的序列了 都一样 定序结果只有 vector 序列
> : 3.直接抽 plasmid 用RE切 结果显示没有插入任何片段
> : 4.把当初 PCR 得到的 insert 片段直接送定序 结果是正确的序列
> : 5.另外 我们实验室有三个人做 cloning 都发生一样的情况 就是 colony PCR 有 band
> : 但定序回来都只剩下 vector 序列
> : 抱歉 问题有点长 其实我的重点就是 为何colony PCR 可 P 到 定序却无结果?> : 那麽 colony PCR 究竟 P 到了什麽东西勒?
> 1. 你挑的是蓝的还是白的?.
> 2. 你的insert 的来源是那里?.
> 3. 放个没有transform 的 E.coli 再 PCR 一次看看
> 顺便做一个只放空vector (没有菌) 与你的primer 再做一次
> 以上简单两个control就能回答你问题
> 4. colony PCR 用 vector 本身的 primer 来 amplify 比较不易出错
s大大的control很有趣
是个好办法
但我满好奇的
为何不抽质体然後切割确认
而要以pcr方式
单纯想知道为什麽而已
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如果美丽必须成为过去
别忘了临走时
请将记忆装入行囊
顺便关上曾经为你而开的窗
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1F:→ pan7353:因为之前直接用PCR确认都有结果 也很快速方便 04/05 20:38