作者skylawer (skylawer)
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标题Re: [求救] colony PCR有P到 但定序无结果
时间Thu Apr 5 09:50:08 2007
※ 引述《pan7353 (要变成自己喜欢的模样)》之铭言:
: 不好意思 这个问题我其实已经问过一次了 但是还是没有解决
: 我的 insert DNA 有 846bp(PCR 得到的)
: 放到 yT&A 的 TA cloning vector 中(用 TA clone 接)
: 蓝白筛选了六个 colony 做 PCR 结果都有 specific 的片段(用insert DNA的primer P)
: 挑了四个 colony 送定序後 结果四个都没有 insert DNA 的序列
: (用 vector 上的 M13 定序)
: 甚至连当初做 colony PCR 的 primer 序列都没有
: 我已经试过的方法
: 1.换 pGEMT system 其他一样 无效(因为我怀疑 colony PCR P 到 vector 上其他序列)
: 2.定序结果我有试过互补和反转的序列了 都一样 定序结果只有 vector 序列
: 3.直接抽 plasmid 用RE切 结果显示没有插入任何片段
: 4.把当初 PCR 得到的 insert 片段直接送定序 结果是正确的序列
: 5.另外 我们实验室有三个人做 cloning 都发生一样的情况 就是 colony PCR 有 band
: 但定序回来都只剩下 vector 序列
: 抱歉 问题有点长 其实我的重点就是 为何colony PCR 可 P 到 定序却无结果?
: 那麽 colony PCR 究竟 P 到了什麽东西勒?
1. 你挑的是蓝的还是白的?.
2. 你的insert 的来源是那里?.
3. 放个没有transform 的 E.coli 再 PCR 一次看看
顺便做一个只放空vector (没有菌) 与你的primer 再做一次
以上简单两个control就能回答你问题
4. colony PCR 用 vector 本身的 primer 来 amplify 比较不易出错
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