作者pan7353 (要变成自己喜欢的模样)
看板Biotech
标题[求救] colony PCR有P到 但定序无结果
时间Wed Apr 4 11:58:13 2007
不好意思 这个问题我其实已经问过一次了 但是还是没有解决
我的 insert DNA 有 846bp(PCR 得到的)
放到 yT&A 的 TA cloning vector 中(用 TA clone 接)
蓝白筛选了六个 colony 做 PCR 结果都有 specific 的片段(用insert DNA的primer P)
挑了四个 colony 送定序後 结果四个都没有 insert DNA 的序列
(用 vector 上的 M13 定序)
甚至连当初做 colony PCR 的 primer 序列都没有
我已经试过的方法
1.换 pGEMT system 其他一样 无效(因为我怀疑 colony PCR P 到 vector 上其他序列)
2.定序结果我有试过互补和反转的序列了 都一样 定序结果只有 vector 序列
3.直接抽 plasmid 用RE切 结果显示没有插入任何片段
4.把当初 PCR 得到的 insert 片段直接送定序 结果是正确的序列
5.另外 我们实验室有三个人做 cloning 都发生一样的情况 就是 colony PCR 有 band
但定序回来都只剩下 vector 序列
抱歉 问题有点长 其实我的重点就是 为何colony PCR 可 P 到 定序却无结果?
那麽 colony PCR 究竟 P 到了什麽东西勒?
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◆ From: 140.112.79.56
1F:推 aminoacid72:会不会是P到原来的insert,但该insert没有接在vector上 04/04 12:26
2F:推 ssuny:colony PCR 会有false positive的情况..抽plasmid切比较保险 04/04 12:51
3F:推 rivis:应该用M13 primer做colony PCR,用原来的primer会P到 04/05 19:59
4F:→ rivis:一些残余的insert DNA,而且最好抽plasmid切切看insert 04/05 20:00